Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN8A6NHC0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN8A6NHC0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms