Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERINC4A6NH21 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms