Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP73A6NFT4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms