Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
ZNF316A6NFI3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNF316A6NFI3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms