Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRD1A4D1F6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms