Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HMX2A2RU54 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms