Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQF3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms