Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YYE9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0J9YYE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0J9YYE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms