Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 STAT6-204ENST00000538913 2879 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PDE2A-202ENST00000376450 3355 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF665-206ENST00000600412 2273 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NT5C1B-201ENST00000304081 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GOSR2-239ENST00000640608 3871 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF436-202ENST00000374608 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SPDYE1-201ENST00000258704 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ATAT1-203ENST00000329992 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EBF2-201ENST00000408929 1888 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PIGN-214ENST00000589720 1853 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GNA13-202ENST00000541118 1502 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CD1E-208ENST00000368163 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CPEB1-215ENST00000617958 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC011337.1-201ENST00000606930 3317 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RASGRP4-201ENST00000293062 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RASGRP4-218ENST00000617966 2927 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KCNN3-203ENST00000361147 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 BTBD10-201ENST00000278174 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SMUG1-AS1-201ENST00000634796 1734 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL359918.1-201ENST00000451892 2720 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KRT8P15-201ENST00000425226 1451 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FPR2-202ENST00000598776 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TEKT3-202ENST00000395930 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SULF2-211ENST00000484875 4238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL139274.2-201ENST00000606274 4127 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 TIMM10B-201ENST00000254616 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 GBA-202ENST00000368373 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PADI4-201ENST00000375448 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DEFA8P-201ENST00000457582 285 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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