Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 LYPD5-201ENST00000377950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 FAM230B-205ENST00000424410 1856 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PIMREG-206ENST00000572595 1551 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 HOPX-211ENST00000554144 1672 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 LINC01503-201ENST00000423122 545 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q6ZVL8 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms