Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USH1CQ9Y6N9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USH1CQ9Y6N9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms