Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRPRBQ9Y5M8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms