Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AFG3L2Q9Y4W6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AFG3L2Q9Y4W6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFG3L2Q9Y4W6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AFG3L2Q9Y4W6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms