Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMED3Q9Y3Q3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMED3Q9Y3Q3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms