Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED7Q9Y3B3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms