Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRELID3BQ9Y3B1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms