Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COQ4Q9Y3A0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COQ4Q9Y3A0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms