Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2D4Q9Y2X8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms