Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPR55Q9Y2T6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GPR55Q9Y2T6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GPR55Q9Y2T6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR55Q9Y2T6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPR55Q9Y2T6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms