Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASF1AQ9Y294 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASF1AQ9Y294 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms