Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NOD1Q9Y239 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOD1Q9Y239 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOD1Q9Y239 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms