Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC2Q9Y235 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC2Q9Y235 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC2Q9Y235 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms