Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HHLA3Q9XRX5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HHLA3Q9XRX5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms