Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-11Q9UQG0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-11Q9UQG0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms