Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMD4AQ9UPU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4AQ9UPU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms