Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTF2Q9UNY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms