Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX12Q9UMY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms