Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DENND2AQ9ULE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND2AQ9ULE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DENND2AQ9ULE3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms