Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP8AP2Q9UKL3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP8AP2Q9UKL3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP8AP2Q9UKL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP8AP2Q9UKL3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms