Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CROTQ9UKG9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CROTQ9UKG9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms