Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C3orf18Q9UK00 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C3orf18Q9UK00 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms