Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIX4Q9UIU6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms