Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIB8

CD84, SLAM family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD84Q9UIB8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CD84Q9UIB8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD84Q9UIB8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms