Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms