Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXF1Q9UBU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NXF1Q9UBU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms