Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3BQ9UBC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3BQ9UBC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3BQ9UBC3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms