Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO1Q9P1Z2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms