Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSRB1Q9NZV6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSRB1Q9NZV6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms