Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCFC1R1Q9NWW0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HCFC1R1Q9NWW0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCFC1R1Q9NWW0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms