Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR3EQ9NVU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3EQ9NVU0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3EQ9NVU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms