Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATAD3AQ9NVI7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms