Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00846Q9NV44 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms