Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB4Q9NTQ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms