Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PDS5BQ9NTI5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PDS5BQ9NTI5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms