Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms