Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TM7SF3Q9NS93 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TM7SF3Q9NS93 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms