Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PAPOLBQ9NRJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms