Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DUOX2Q9NRD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.64■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DUOX2Q9NRD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms