Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31BQ9NQW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31BQ9NQW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31BQ9NQW1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms