Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC4CQ9HCJ2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC4CQ9HCJ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC4CQ9HCJ2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms